Alexander Ennen studierte Informationstechnik an der Georg-Simon Ohm Hochschule in Nürnberg und Informatik an der Fernuniversität Hagen.

Seit 2009 arbeitet er beim Fraunhofer-Institut für integrierte Schaltungen IIS im Bereich Röntgenbildgebung. Seine Arbeiten fokussierten sich dabei auf Mehrenergiesysteme für Sortierung und Gepäcksicherheit. 2016 übernahm er die Leitung der Gruppe „Sortier- und Laborsysteme“ die sich mit Fragestellungen aus den Bereichen Bergbau und Recycling auseinandersetzt.

Seit 2020 ist er Abteilungsleiter der Abteilung „Anwendungsspezifische Methoden und Systeme“, die sich neben der Sortierung mit Hochenergiebildgebung und Phänotypisierung beschäftigt.